Tummapehmeäkilpikonna (Nilssonia nigricans) on pehmeäkilpikonniin kuuluva matelijalaji. Lajia tavataan uhanalaisena Etelä-Aasiasta.
Tummapehmeäkilpikonna on suurikokoinen pehmeäkilpikonna: sen selkäkilven pituus voi olla 78 (mahdollisesti 91) senttimetriä, ja laji voi painaa 57 kilogrammaa. Selkäkilpi on oliivinvihreä ja matala, ja sarveislevyjen puuttumisen takia se tuntuu pehmeältä. Kuten muillakin eteläaasialaisilla pehmeäkilpikonnilla, myös tummapehmeäkilpikonnan nuorilla yksilöillä on kilvessä selväpiirteisiä samankeskisiä ympyräkuvioita, jotka vuorottelevat tumman ja vaalean välillä. Vanhoilla yksilöillä selkäkilpi on lähes tasavärinen. Tummapehmeäkilpikonnan pää ja raajat ovat tummat, ja sillä on uimaräpylät. Kaula on melko pitkä, ja sierainaukot sijaitsevat lyhyen kuonon päässä.
Luonnossa tummapehmeäkilpikonnaa tavataan Brahmaputrajoesta Intiasta ja Bangladeshista. Tämän lisäksi se elää eräiden intialaisten ja bangladeshiläisten temppelien lammikoissa. Tummapehmeäkilpikonna tulee täysikasvuiseksi 7–10 vuoden iässä.
Tummapehmeäkilpikonnan katsottiin olevan luonnosta hävinnyt, kunnes 2000-luvulla löytyi villi kanta Brahmaputrasta. Nykyään laji luokitellaan äärimmäsen uhanalaiseksi ja kantaa uhkaa pyydystäminen ravinnoksi. Temppeleiden kilpikonnilla on suuri merkitys kannan säilymiseen.
Tummapehmeäkilpikonna on vesielämään sopeutunut taitava uimari, ja se pyydystää ravinnokseen kaloja sekä nilviäisiä ja muita vedessä eläviä selkärangattomia.
