Atopophrynus syntomopus, unique représentant du genre Atopophrynus, est une espèce d'amphibiens de la famille des Craugastoridae.
Le nom de ce genre vient du grec atopos, étrange ou déplacé, et du grec phrynos, le crapaud.
La femelle holotype mesure 19,3 mm.
Cette espèce est endémique du département d'Antioquia en Colombie. Elle se rencontre dans les environs de la municipalité de Sonsón, à environ 2 780 m d'altitude dans la cordillère Centrale.
Sa zone d'occupation de 10 km2 voit la dégradation de son habitat ce qui la classe parmi les espèces en danger critique d'extinction.