Phyllodactylus rutteni est une espèce de geckos de la famille des Phyllodactylidae.
Cette espèce est nommée en l'honneur de Louis Martin Robert Rutten (1884-1946).
Cette espèce est endémique des Dépendances fédérales au Venezuela. Elle se rencontre sur les îles de Blanquilla, de La Orchila, de la Tortue dans les archipels de Los Roques et de Los Hermanos.