Górskie lasy, głównie liściaste i mieszane. Występuje zazwyczaj w przedziale wysokości 2500–4270 m n.p.m.
W Czerwonej księdze gatunków zagrożonych IUCN sikora czarnoczuba klasyfikowana jest jako gatunek najmniejszej troski (LC, Least Concern). Liczebność populacji nie została oszacowana, ale ptak ten opisywany jest jako pospolity w Himalajach, Tybecie i Mjanmie, a rzadki na innych obszarach. Ze względu na brak dowodów na spadki liczebności bądź istotne zagrożenia dla gatunku, BirdLife International ocenia trend liczebności populacji jako stabilny.
