Magdalenatapakulen är en 11 cm lång typisk Scytalopus-tapakul med övervägande skiffergrå fjäderdräkt, på buken något beigebandad. Den känns lättast igen på lätet, bland de mest anspråkslösa i släktet med en enkel ton som upprepas fyra till fem gånger per sekund med två till fem fraser i stöten.
Magdalenatapakul delas in i två distinkta underarter:
