Svartstrupig myrtörnskata är en rätt liten myrtörnskata. Hanen är mörkgrå med svart strupe. Honan är bruntonad ovan och gulbrun under, med kontrasterande vitaktig strupe. Arten är lik askgrå myrtörnskata, men skiljer sig i strupfärg och sång. Den senare består av en serie gradvis stigande toner med en hård slutpunkt.
Svartstrupig myrtörnskata delas in i två underarter med följande utbredning:
Svartstrupig myrtörnskata hittas i undervegetation i låglänta fuktiga skogar. Den deltar ofta i artblandade kringvandrande flockar där den vanligen intar en ledarroll. Fågeln besöker tillfälligtvis svärmar med vandringsmyror.