Svartnäbbad frötangara är en finkliknande fågel med mycket kraftig, mörk näbb. Hanen är svart med en liten vit vingfläck som dock kan vara dold på sittande fågel. Honan är svår att artbestämma om den inte ses tillsammans med hanen. Jämfört med hona kastanjebukig frötangara är den dock mindre och något mörkare än hona ljusnäbbad frötangara.
Svartnäbbad frötangara delas in i två underarter:
Svartnäbbad frötangara bebor fuktiga gräsrika områden, ofta nära vatten, i låglänta områden och lägre bergstrakter.
Arten har ett stort utbredningsområde och beståndet anses stabilt. Internationella naturvårdsunionen IUCN listar den därför som livskraftig (LC). Den beskrivs dock som sällsynt förekommande.